| Tytuł projektu: |
Ocena i identyfikacja molekularna obiektów w banku genów. |
| Kierownik projektu: |
dr hab. M. Boczkowska, prof. Instytutu |
| Numer umowy: |
DHR.bz.070.1.2022 |
| Planowany okres realizacji: |
2022 |
| Planowany budżet: |
141 100 zł |
Wykonawcy (tylko naukowi):
- dr M. Puchta-Jasińska
- mgr S. Kowalik
- mgr P. Bolc
Szczegółowy opis zakresu rzeczowego zadań w 2022 r.:
Cel zadania: wykorzystanie oceny zmienności molekularnej zebranych obiektów ze szczególnym uwzględnieniem populacji miejscowych do analizy pod kątem identyfikacji obiektów, identyfikacji duplikatów i sprawdzenia taksonów wątpliwych.
Opis zadania:
W zadaniu zostaną wykorzystane jako techniki ewaluacji obiektów, analizy molekularne.
- Ocena stopnia podobieństwa genetycznego 90 obiektów z kolekcji pszenicy banku genów.
- wykonanie analizy DNA przy użyciu technologii DArTseq
- umieszczenie uzyskanej sekwencji DNA w ogólnodostępnych bazach danych. Ze względu na rozmiar, surowe dane DArTseq zostaną zdeponowane w bazach danych o otwartym dostępie (np. NCBI, Open Science Framework, Repozytorium Centrum Otwartej Nauki CEON). Ponadto do bazy danych EGISET dołączony zostanie plik zawierający komentarz do uzyskanego wyniku analizy. W bazie danych EGISET zostanie załączony link umożliwiający pobranie danych. Dane bibliograficzne publikacji zostaną dołączone po jej ukazaniu się.
- Ocena stopnia podobieństwa genetycznego 90 obiektów z kolekcji żyta banku genów (populacje miejscowe i stare odmiany).
- wykonanie analizy DNA przy użyciu technologii DArTseq,
- umieszczenie uzyskanej sekwencji DNA w ogólnodostępnych bazach danych. Ze względu na rozmiar, surowe dane DArTseq zostaną zdeponowane w bazach danych o otwartym dostępie (np. NCBI, Open Science Framework, Repozytorium Centrum Otwartej Nauki CEON). Ponadto do bazy danych EGISET dołączony zostanie plik zawierający komentarz do uzyskanego wyniku analizy. W bazie danych EGISET zostanie załączony link umożliwiający pobranie danych. Dane bibliograficzne publikacji zostaną dołączone po jej ukazaniu się.
- Przygotowanie w terminie do dnia 28 października podsumowania realizacji zadania „Ocena i identyfikacja molekularna obiektów w banku genów” ze szczególnym uwzględnieniem wykorzystania uzyskanych wyników w hodowli roślin